MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Aeromonas hydrophila subsp. hydrophila ATCC 7966 chromosome

Total Repeats: 12716

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_008570	GCCT	2	8	4678542	4678549	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12502	NC_008570	GCC	2	6	4679734	4679739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12503	NC_008570	CGG	2	6	4679784	4679789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12504	NC_008570	AAC	2	6	4679849	4679854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12505	NC_008570	CAG	3	9	4679881	4679889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12506	NC_008570	GGC	2	6	4679935	4679940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12507	NC_008570	CGGC	2	8	4679983	4679990	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12508	NC_008570	CGGG	2	8	4680010	4680017	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
12509	NC_008570	CAG	2	6	4680074	4680079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12510	NC_008570	CTGA	2	8	4680182	4680189	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12511	NC_008570	GC	3	6	4680390	4680395	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12512	NC_008570	GCA	2	6	4680454	4680459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12513	NC_008570	GCCG	2	8	4680492	4680499	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12514	NC_008570	CAG	2	6	4680512	4680517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12515	NC_008570	GCG	2	6	4680530	4680535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12516	NC_008570	CCA	2	6	4680582	4680587	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12517	NC_008570	GAT	2	6	4680612	4680617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12518	NC_008570	CGG	2	6	4681580	4681585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12519	NC_008570	AATGG	2	10	4681629	4681638	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
12520	NC_008570	CTT	2	6	4681647	4681652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12521	NC_008570	AGCATG	2	12	4681671	4681682	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
12522	NC_008570	TTG	2	6	4687275	4687280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12523	NC_008570	TTG	2	6	4687337	4687342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12524	NC_008570	CTT	2	6	4688591	4688596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12525	NC_008570	AAC	2	6	4688616	4688621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12526	NC_008570	T	7	7	4689699	4689705	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12527	NC_008570	GAA	2	6	4689736	4689741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12528	NC_008570	CA	4	8	4689769	4689776	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12529	NC_008570	ATA	2	6	4689828	4689833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12530	NC_008570	CTG	2	6	4689839	4689844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12531	NC_008570	A	6	6	4689864	4689869	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12532	NC_008570	TGA	2	6	4690344	4690349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12533	NC_008570	GTAGG	2	10	4690366	4690375	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
12534	NC_008570	ATG	2	6	4694718	4694723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12535	NC_008570	GGC	2	6	4694727	4694732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12536	NC_008570	GCAG	2	8	4694750	4694757	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12537	NC_008570	GCC	2	6	4694800	4694805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12538	NC_008570	GAT	2	6	4694834	4694839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12539	NC_008570	GTCG	2	8	4696528	4696535	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12540	NC_008570	ACC	3	9	4697374	4697382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12541	NC_008570	GGC	2	6	4697392	4697397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12542	NC_008570	CT	3	6	4697413	4697418	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12543	NC_008570	GAT	2	6	4697426	4697431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12544	NC_008570	GAT	2	6	4697434	4697439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12545	NC_008570	TGCG	2	8	4697463	4697470	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12546	NC_008570	A	7	7	4697483	4697489	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12547	NC_008570	CTT	2	6	4697509	4697514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12548	NC_008570	GCGGA	2	10	4697522	4697531	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
12549	NC_008570	CCGCT	2	10	4697590	4697599	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
12550	NC_008570	TTC	2	6	4697669	4697674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12551	NC_008570	GGT	2	6	4697781	4697786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12552	NC_008570	GCC	2	6	4697801	4697806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12553	NC_008570	TTC	2	6	4697814	4697819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12554	NC_008570	TAG	2	6	4697877	4697882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12555	NC_008570	CTT	2	6	4697912	4697917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12556	NC_008570	CGC	2	6	4697972	4697977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12557	NC_008570	AC	3	6	4697982	4697987	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12558	NC_008570	GTTC	2	8	4698151	4698158	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12559	NC_008570	ATC	2	6	4698195	4698200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12560	NC_008570	ACG	2	6	4698235	4698240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12561	NC_008570	TGA	2	6	4698315	4698320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12562	NC_008570	CCG	2	6	4698343	4698348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12563	NC_008570	ACC	2	6	4698430	4698435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12564	NC_008570	CCT	2	6	4698512	4698517	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12565	NC_008570	CTC	2	6	4698549	4698554	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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12568	NC_008570	GGT	2	6	4698654	4698659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12569	NC_008570	GTA	2	6	4698751	4698756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12571	NC_008570	TC	3	6	4699176	4699181	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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12573	NC_008570	ACC	2	6	4699347	4699352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12574	NC_008570	C	6	6	4699404	4699409	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12575	NC_008570	GAG	2	6	4699535	4699540	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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12577	NC_008570	AC	3	6	4699609	4699614	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12578	NC_008570	CGACT	2	10	4699713	4699722	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
12579	NC_008570	CTTT	2	8	4699737	4699744	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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12590	NC_008570	GTCA	2	8	4700379	4700386	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12591	NC_008570	GGA	2	6	4700402	4700407	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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12595	NC_008570	CGCTA	2	10	4700640	4700649	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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12599	NC_008570	ACA	2	6	4700863	4700868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12604	NC_008570	AAG	2	6	4701043	4701048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12607	NC_008570	GCT	2	6	4701169	4701174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12611	NC_008570	TG	3	6	4701296	4701301	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12612	NC_008570	CAA	2	6	4701308	4701313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12613	NC_008570	TAAGG	2	10	4701325	4701334	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
12614	NC_008570	GT	3	6	4701473	4701478	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12615	NC_008570	ACG	2	6	4701574	4701579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12617	NC_008570	ATG	2	6	4701667	4701672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12624	NC_008570	TTC	2	6	4701895	4701900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12625	NC_008570	GCC	2	6	4702138	4702143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12626	NC_008570	TCC	2	6	4702158	4702163	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.